Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NXPE2Q96DL1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NXPE2Q96DL1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms