Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMD3Q96D46 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms