Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPTNQ96CV9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms