Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSUN4Q96CB9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms