Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC127Q96BQ5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC127Q96BQ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms