Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1AQ96AJ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms