Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms