Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMTQ93088 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMTQ93088 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms