Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRG4Q92954 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms