Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CTTNBP2Q8WZ74 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms