Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRIPQ8WXE1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms