Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GAB3Q8WWW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAB3Q8WWW8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms