Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE2Q8WWL2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms