Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf54Q8WWF1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf54Q8WWF1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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