Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms