Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF398Q8TD17 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms