Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH4

NUP37, Nucleoporin Nup37, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP37Q8NFH4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP37Q8NFH4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP37Q8NFH4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP37Q8NFH4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP37Q8NFH4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP37Q8NFH4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP37Q8NFH4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP37Q8NFH4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms