Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCPH1Q8NEM0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms