Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNRF1Q8ND25 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms