Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00116Q8NCU8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms