Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms