Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP38Q8NB14 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP38Q8NB14 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP38Q8NB14 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms