Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms