Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD53Q8N9V6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD53Q8N9V6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD53Q8N9V6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms