Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBL4BQ8N7F7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms