Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD4Q8N4Q1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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