Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3X1

FNBP4, Formin-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP4Q8N3X1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FNBP4Q8N3X1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FNBP4Q8N3X1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms