Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML4Q8N228 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms