Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms