Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NME9Q86XW9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NME9Q86XW9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms