Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms