Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEGR1Q7Z3B1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms