Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms