Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00173Q6ZV60 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms