Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD6Q6ZSS7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD6Q6ZSS7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD6Q6ZSS7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms