Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHISA6Q6ZSJ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms