Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM136Q6ZRR5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms