Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFXL1Q6ZNB6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms