Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A10Q6U841 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms