Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRWD3Q6RI45 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRWD3Q6RI45 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms