Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF7Q6Q0C0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms