Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms