Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN8Q6JVE9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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LCN8Q6JVE9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN8Q6JVE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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