Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPPQ6IPU0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPPQ6IPU0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms