Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPRIN2Q6IMN6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPRIN2Q6IMN6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms