Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms