Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
INTS3Q68E01 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms