Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102BQ68D86 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102BQ68D86 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms