Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNS3Q68CZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms