Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WSCD1Q658N2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WSCD1Q658N2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms